下来，大明朝堂整个换了个模样，京城也在一番整顿之后，显露出了全新的风气。在处理了早就看不顺眼了的周延儒等大臣之后，崇祯又让已经步入正轨的军事部，开始对京师周边几省的军务渗入。
先是令刘国能率一万羽林军，沿着已经修筑好的水泥路，进军天津口。将天津口的防务拿下来后，转道进入山东，传诏山东总兵刘泽清进京。刘泽清拖病不从，刘国能当晚便奇兵突进济南府，生擒刘泽清押解进京。
趁着刘国能的天子羽林军掌控整个山东之际，卢象升之弟卢象晋卢象观拉开了召兵大旗，一月之间便招齐了十万青壮，在羽林军的基层种子军官的训练之下，迅速成军接掌了山东的防务。
然后刘国能率羽林军转道山西，此时山西各将官根本不敢与刘国能抗衡，被刘国能轻松接管了山西的防务。
曹变蛟趁机在山西拉开召兵的旗帜，召满了十万青壮。刘国能留下五千羽林军协助曹变蛟，毕竟闯贼就在陕西，光是曹变蛟的十万新军，还是有些力不从心。
与此同时，马祥麟带着五百羽林军回到了四川，周遇吉则带了五百羽林军去了湖广，分别征召十万青壮，没日没夜的训练着。
吴三桂则带着五千关宁铁骑和一千羽林军进入了河套草原，武力征讨河套，将河套地区的蒙古部落或收服或驱逐，一举将大明的边境推过了阴山。
一年后，回到福州组建成了太平洋舰队的郑森，率先行动率军直取大员，（也就是后世的台湾岛，）一举驱逐了荷兰人，将大员置与大明的统辖之下。
马祥麟、周遇吉、曹变蛟、卢象观紧随其后发起军事行动，只有卢象晋带着五万大军做为机动部队，随时支援需要支援的地方。
盘踞武昌的献贼张献忠，在马祥麟所部与周遇吉所部的围攻之下，被迫沿着明军给出的路线逃亡，最终退出了湖广，被逼进入了陕西与闯贼李自成合流。
而在赶走献贼张献忠后，马祥麟与周遇吉借口举办庆功宴，宴请了湖广巡抚知府，以及平贼将军左良玉。宴会前，没有人会想到同是明军的马祥麟与周遇吉，会对拥有十万大军的平贼将军左良玉下手。
宴会中，原兵部尚书，现大明西南军区参谋长的杨嗣昌，在众人兴高采烈之时，忽地起身怒斥左良玉拥兵自重，劫掠百姓，杀良冒功等十条大罪。左良玉心惊之下，便想离去回到军营。却被周遇吉当场率人擒了下来。
在场的官员个个冷汗如雨，大明新军太过强势，而今文武分治，文官再也不能
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