危急时刻，穿越者的掌握的科学知识开始发挥威力，在惊涛骇浪中力挽狂澜。在宋友亮的指挥下，官兵首先安排将病人隔离，一切病人接触过的东西统统用火烧掉，排泄物、分泌物统统丢进石灰桶。搬运尸体或者接触病人的人，要穿上厚厚的衣服，带上口罩和手套。接触结束之后，这些衣服、手套也要虽尸体一起统统烧掉
随后便是开始种痘免疫，用棉花醮取痘疮浆液塞入接种人鼻孔中，或将痘痂研细，用银管吹入鼻内使之轻度感染，通过如上方法使之产生抗体来预防天花。又或者去少量的疮浆涂抹到健康人的伤口上，使之轻度感染，从而产生抗体。这种土办法虽然比不上现在的疫苗接种，在当时来说已经是相当高明的手段了。
很快，济南的天花病得到了遏制，通过土法接种的感染者，七八千人之中，只有一二十人死亡。感染天花的人从每天几千人开始下降到每天几百余人，再下降到每天不过一二十人。到十二月十二日，清军完成对济南的包围时，济南城中每天出现的天花病人不超过三十人，而且得到了有效的隔离。
城外，清兵大军云集，除了漫山遍野黑压压地人头之外，就是红的耀眼的镶红旗大纛。
德王虽然不得不相信清兵确实绕过德州要攻济南，但是他仍然指望有守土之责的地方文武会慑于国法，也为保自己身家性命，出死力固守城池，等待救兵。就在清兵围成的当天下午，他由两个太监搀扶着巡视仓库。他叫典库官打开一座被叫做东二库的大屋子，看看里边堆满金银和铜钱，德王抚摸着一定银元宝，象抚摸自己的心头肉：“这都是本王辛辛苦苦几十年来十年来自己经营的家产，我连一个钱也舍不得不给人！”他希望过此一时，济南太平无事，他还要拼命从王庄、王店、茶引和盐引等方面聚敛钱财。
随后，德王派人把宋学朱叫进宫去，问他关于守城的事。宋学朱说海阳卫已经有3000兵马来援，即墨营也有700兵马来援，自己也派出了七批使者向朝廷求援。听了这些话，德王的心情为之一宽，点头说：“宋巡按倒是个大大的忠臣。事定之后，寡人要向皇上题本，重重奖赏你的大功。”
宋学朱趁机起立说：“济南守城官兵，欠炯日久，咸有怨言。请王爷殿下速速
发出几万饷银，以牢固军心。同时海阳、即墨的客兵也需要发饷以资鼓励！”
德王喘着气说：“你们这些人啊，一提到守城打仗就要银子，要银子！你们以为王宫中藏有摇钱树、聚宝盆！取之不尽用之不竭？”
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