皇子的军政也是在模仿高文的基础上有所改动，他让莫利亚和帖萨利全部的农民在田地上耕作，而后委托自己的奴隶阿克塞颇考斯统管商务贸易。将所得利润，全部在帝国境内招募士兵组成新军。皇子的招募对象，大致分为两处：一是伊庇鲁斯地区的彪悍山民，这群人根本无心种植农田，那里也没什么耕地可供谋生，于是乎“挎上马刀，牵着匹马，带着三个烂衣服的老婆和七个光屁股的孩子，后面还跟着个正教的土神甫”，成群结队在约翰皇子的招徕下，进入色萨利城入营——皇子将他们的家属安置在营市附近，发部分薪资和军备，其余的授予田地来抵偿；还有一处，是帖萨利和塞萨洛尼基交界处的河流，即瓦达瑞泰河谷当中，在这里始终生活着支百年前皈依正教的“波斯归化族”，其来源到底是马扎尔人、保加尔突厥人已无人关心，反正皇都的官僚统统都以波斯人称呼他们——皇子以免除赋税的条件，和管理他们的叔叔伊萨克.科穆宁（伊萨克现在驻在阿索斯圣山附近办公收税）达成了协议，让这群人携带着战马入营宣誓服役。
接着，皇子将伊庇鲁斯人统统编练为轻矛手和弓箭手，而瓦达瑞泰骑兵则全部发放轻便的亚麻甲（确切说是亚麻和缀甲片的混合）和反曲弓，就这样短时间内就编练出两千骑兵和三千步兵，称为“莫利亚新军”，总教习官是皇子的军事顾问泰提修斯和帖萨利的杜盖留斯狄奥格尼斯两位。
随后，皇子又模仿高文和安娜的具装骑兵，也组建了支重装骑兵队伍，共六百人，其中二百人是募集来的诺曼、意大利、法兰克流浪佣兵，身披甲胄手持骑矛，称作“枪骑兵”；其余四百人是本土的骑兵，但却不是普洛尼亚地主充当的，大部分都是皇子征集来的牧人或小吏，亦披着扎甲，用轻型的短矛和弓箭配合“枪骑兵”作战，被称作为“轻骑兵”——这支队伍比起具装骑兵来，作战更加迅猛轻便。所有骑兵的夹枪冲锋或格战训练，皇子全部交给了布洛瓦伯爵和诺曼底伯爵，这两位被皇子以高薪和特许的封邑给聘来，在此为皇子效力，这种情况并不稀奇：罗马皇帝和将军很早就雇佣贫穷勇猛的西方人，担当佣军了。
乘着此次朝圣者对达尼什蒙德的大举征伐，皇帝也部属了各路战线：
皇帝亲自拨出五百名特科波士兵，为“劳迪西亚大伯爵”雷蒙德保驾护航；
科萨和布雷努斯各出三千步骑，顺着非拉多菲亚姆和阿菲永北上，统统交给哈罗德统率，皇宫侍卫长米哈伊尔辅之，加上原本驻屯在比提尼亚的人马，凑齐八千人“尾随”朝
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