枢密使这一官衔在唐太宗时就设置了，但唐代的枢密使只负责管理军事情报，机密情报之类，由宦官兼任，直至五代时还保留这个官衔。宋太祖为了消除军阀割据的隐患，同时，枢密使的设立又可以削弱宰相的权力，也是强化皇权的重要措施。
所以，元丰改制后，枢密院照样保存下来，但是北宋的枢密使与中书的关系都极不正常。时人曾言：枢密使每朝奏事，与中书先后上，所言两不相知，以故多成疑贰。枢密院官虽曰掌兵，亦未尝不兼任宰相之事。宋神宗的御史滕达道也说，战守安危之所政，中书主打，枢密使主守，这样怎么能取胜呢？明确指出这种互相牵制所造成的殆误军国大政的弊端。
到了南宋高宗接受了这一教训，为了对付经常性的对外战争，不得不实行兵政合一，设立“平章军国重事”这一官衔。在此后的一段时间内，这种兵政合一的措施确实起到了稳定战局的作用，但是随着御前护军的壮大，军将权力过大的弊端又重新显现，甚至发生兵变将高宗赶下台，因而又设法收取领兵军将的权力，并以宰相兼任枢密使。
不过南迁之后战事不断，历代皇帝只能设置督抚镇守前线要地，因此也不得不通过放权、收权，甚至频繁换将来控制军队。但依然未能阻止军事集团的形成和扩张，以致形成尾大不掉之势，他们在各自利益受损后，便不顾国家利益叛降，从而导致整个防线的崩溃，并助纣为虐成为灭宋的主力。
赵昺知道要想彻底解决问题只能通过制度，而不是人治。可也清楚自己只是历史的搬运工，让他做一个好工匠完全没有问题，但是处理这种军国大事还真不在行，且自己前世根本没有这方面的经验，要主持并进行这么大的机构调整还真没有底儿。
不过赵昺也明白若是不能解决这个问题，自己的地位终归不稳。而当前行朝尚处于混乱和初建时期，各派势力相对于较弱，并且要依附自己才能生存，因此也是调整机构的最佳时期，一旦错失这个窗口期将更加困难。所以他决定即便此次革新存在不合理的地方，也要坚决的搞下去，将基本原则定下来再逐渐完善。再说了在中国人民的智慧面前，制度什么时候都是有空儿可钻的……
在赵昺改革后的枢密院的主要职责类似于现代的参谋部，其主要职责用一个词表达就是——打仗。制定国家的最高军事战略；决定战时人力和物力资源的分配使用；向皇帝和中书省提供军事决策方案。作为“最重要的军事顾问“，枢密院有包括制定军事战略、指导国防预算、作战及联合演习计划
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