众徒南迁，想同以前的大德一样，寻找一个隐身修行之所。
刚到光州，就赶上梁元帝倾覆，国家大乱，向南的道路被阻。
慧思和众弟子不得不暂时住在大苏山。
几年的时间，前来投奔慧思的弟子如潮水涌起一样多。
大苏山在陈齐两国边境，两国交战，佛法弘扬受到阻碍，许多人害怕战争，相继散去。只有那些有志于行道的，不惜生命，留下来向慧思学法。
慧思向他们传授禅定之法，讲授佛理。
接着，众人又请慧思讲《般若》和《法华》二经。
慧思所讲的内容，都能阐发佛经的玄妙之意。
江陵前来学法的智顗，聪明智慧，学识广博，慧思让他代自己讲经。
智顗讲到一心具万行之处，感到有些疑惑。慧思给他解释说：“这是大品次第之意，不是《法华经》的圆顿之说。我过去在夏休时，就苦于思考这个问题。在一天夜晚，我忽然感到一念生出万法，从而印证了这种说法。”
智顗接受了慧思所授的法华行法三七境界，又问慧思的师位是否是十地，慧思说：“不是。我是十信铁轮位。”
其实，以慧思所证得的境界来说，已到了长别苦海的程度，只是他本人谦虚退让，听其言很难见其实。
陈光大六月二十二日 ，慧思又带着众弟子，向南岳进发，开始了融合南北佛教的伟大事业。
慧思到达南岳后，告诉众僧说：“我要在这里住十年，十年以后，我就要远游他方。”
又说“我前世的时候，曾到过这里。”
衡阳附近有一个风景优美的地方，林静泉清，见到的人都很高兴。
慧思说：“这是古寺院，我过去曾住在这里。”
按慧思的说法，众人掘开地面，果然看到了房基和一些僧人用具。
他们走到岩下时，慧思：“我过去在这里坐禅时，贼人砍了我的头，因而丧命。现在是我再次转世之身。”
众人共同寻找，发现了一具枯骨，又仔细寻找，找到一个头骨。
慧思拿着头顶在头上，后来又为它建造了一座塔，以报答前世之恩。
慧思在南岳讲经授法，山门弟子云集，名声日高。
有一个异道心怀嫉妒，密告陈皇帝，说慧思是北地僧人，受齐的指使，前来破坏。
陈皇帝派使者前去探查。使者走到半路，遇到两只虎在前面愤怒地咆哮，使者惊吓而退。几天
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