容易偏离高层管理者的原计划，比如打折扣的执行甚至是被缓兵之计。
三是资源未被整合。层级意味着缓冲，也意味着协调，甚至意味着相互反馈和谈判。众所周知，正如集思广益得来的决定更容易得到各层级认可和有效落实，经过谈判得来的协议也更可能被参与谈判的各方遵守。一个指令传到基层干部那里，基层干部会根据上级指令的本来目的，和一线办事人员进行协商和反馈，并及时把反馈意见经过适当过滤之后告知发出指令者，上级根据反馈，基于指令目的，修正指令形式。很显然，这种反馈之后的指令形式更容易得到贯彻落实。因为人最怕被得到可怜的那么一点尊重，一旦感受到自己被尊重，能量就可能在瞬间爆发，主观能动性也就生长出来。
没有中间层级的过滤，很多意见也太过于直观，太过于缺乏相互了解——一线办事人员往往不了解高层领导的难处，太过于缺乏资格，以至于无法进行谈判。毕竟谈判要求有谈判的资格，要求谈判双方的政治势能落差不是太大。这也是我们只见过皇帝和将军谈判没见过皇帝和小兵谈判的原因。
由此可见，对组织效率和效果来说，越级指挥是很不划算的。但是，君不见，史载某皇帝竟然问文武百官旱灾饥民没饭吃为何不吃肉的问题，所以，个人认为，越级了解实际情况是非常有必要的，因为这样可以防止被屏蔽在信息的枷锁里。
越级指挥是指公司的高层管理人员直接跨级到基层管理事务。一般来说，公司高层的工作原则是：越级检查，但是不能越级指挥。越级检查可以，为了了解组织的工作结果是否能与当初制定的方向目标一致，高层可以一竿子插到底，这是对整个管理水平的监督和检查，无可非议。但越级指挥则具有相当大的危害。首先，越级指挥挫伤了中层管理者的积极性。既然你请他撞这个钟，那就让他撞，这叫信任，请过来又不让他撞，这是咋回事嘛；其次会搞乱组织秩序，越级指挥会使中间层级无法正常行使自己的职责，从而导致整个组织出现混乱。再次，也会使员工为难，员工会因为上级的分歧而左右为难，进而可能会影响工作效率。越级还有可能会培养出一批“通天”的特殊员工出来，不服正常管理，这会对公司的健康机体有害。
越权指挥，容易产生下属执行的两难境地，毕竟每个管理者有自己的工作习惯和风格。当然，事急权变，只要过程中或过程后知会直接管理者，上下都能理解和接受，毕竟都是为企业着想。越权沟通，在一流组织里面的正常规定是当直接管理者不同意某种
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