事局，负责官吏的考核、奖惩、升降、归档。
民政使相当于民政局、社保局，负责关系到民生，尤其是低收入百姓民生的各种事项。吏房长官由人事使兼任，相当于分管人事、民政的副市长。
户房设置的官职最多，因为涉及的政府职能也最多。税务使和财政使，顾名思义，就相当于税务局和财政局。这两个部门都是管钱的，不同的是一个管收钱，一个管花钱。过去衙门里这两项工作是混为一谈的，朱由检认为十分不妥，现在把他们彻底分开。这样收支两笔账分别管理，便可有效防止“小金库”、“坐收坐支”等问题。
粮库使就是粮食局。在这个“民以食为天”的时代，粮食是最重要的战略资源。但是过去衙门除了每年收田赋，对粮食的流通及价格却完全放任自流，导致经常出现粮价暴涨暴跌，或是缺粮断粮等情况，极大地威胁着国家安全和百姓生活。朱由检设立粮库使，就是要对地方政府存粮进行有效管理，不但要做到库里始终有粮、以备不时之需，还要发挥平抑粮价的功能。
工商使专门管理工业、矿业、手工业和商业，比前世的工商局权力要大得多。“士农工商”，工商排在末位，过去从业者的社会地位是很低的。但是在朱由检看来，工业和商业创造社会大多数财富的时代即将到来，必须从政府层面进行强有力的引导，所以这个职位也非常重要。
农林使负责农林牧副渔，房地使负责田产和房屋的登记。另外房地使还兼有国土资源局、规划局的职能，随着工业的发展，土地性质变更的事会越来越多，所以这也是个忙碌的职位。
审计使相当于审计局，负责审查全衙门所有账目，意义不言而喻。财政使兼任户房长官。
归到礼房的职位只有两个。文教使负责文化、教育、宗教等方面事项；卫生使管理地方上的所有医馆、药铺、郎中，朱由检也准备把太医院在各地开设的医院管辖权逐渐移交到地方。文教使兼任礼房长官。
兵房职位更少，只有一个民团使，负责地方民团的管理和训练，当然也就是兵房长官。因为军政非常特殊，涉及到军户制的改革，还涉及到统兵调兵等非常敏感的问题，朱由检不打算让地方衙门过多染指。至于民团，朱由检将其视为预备役，要由地方衙门管起来，而非各地地主的私募武装力量。
刑房的四个职位，分别对应现代的公安局、检察院、法院和监察局。公检法各司其职，互相配合而又互相制约，既有利于提高办案水平，又可在一定程度上防止徇私枉法，
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