炸弹的命中让加贺号完全丧失了作战能力，在七点三十分伴随着太阳下山，加贺号被下令弃舰，在夜色中加贺号火势延烧到汽油槽引发大爆炸，不久舰体断成两截带着大部分舰载机沉入了海底。
在加贺号受到重创的时候，其他日本舰船的处境也不乐观，和加贺号呈上难兄难弟的是飞龙号，在加贺号被击中没有十分钟，飞龙号也被一枚炸弹击中舰艏。
飞龙号这艘航母是日本第二代专门设计的航母，在设计建造时，日本海军基于“友鹤事件”以及“第四舰队事件”的教训，对“飞龙”号的设计也产生影响。飞龙号和苍龙号比，进一步加强了舰体结构强度，提高了舰艏干舷，改进了装甲防护，飞龙号比苍龙号稍宽一些，排水量比苍龙号更大，有别于“苍龙”号的双船舵设计，“飞龙”号则改为单船舵。
飞龙号航空母舰最大的变化是岛式上层建筑改到了左舷(苍龙号岛式上层建筑位于右舷)。当时海军航空本部对“飞龙号”的设计提出建议，岛式上层建筑的理想位置应该尽可能靠近船体中部，中部也是烟囱的最好位置，于是干脆把岛式上层建筑移到左舷。按日本海军的逻辑，两艘姊妹舰在并行时，准备在左边舰上(苍龙号)降落的飞机，在上空整理队形或返航准备降落时，可以向左盘旋；在右边舰上(飞龙号)降落的飞机可以向右盘旋，两舰的飞机不会发生空中交通冲突。这种见解在航空母舰“赤城”号和“加贺”号进行现代化改装的时候就被采纳了。但英国航空母舰的实践已经表明，飞行员在降落过程中一旦碰到麻烦，由于某些原因往往向左转，左舷岛式上层建筑造成的降落事故比右舷多一倍。实际上，“赤城”号在“飞龙”号竣工之前完成改装，实践表明并不象想象中的那样，但要补救“飞龙”号上层建筑配置在左舷的问题已经来不及了。
在这次出征中，飞龙号与苍龙号编为第二航空战队。作为第二航空队的旗舰，在被命中第一发炸弹后，山口多闻当机立断命令部队吧还在甲板上堆积的加油的油罐车和弹药全部推入海中，所有的飞机不管什么飞机全部起飞。但是这个命令植被执行了一半，飞机根本没办法起飞，因为在高速机动时起飞就是在玩命。接下来一段时间飞龙的运气似乎好了不少，中国飞机投下来的炸弹似乎都有意识的偏航，对飞龙号都没有构成威胁。
正在全舰的船员都在感谢天照大神照顾时，随着一声轰天巨响。在指挥室里指挥作战的山口多闻被猛地甩在了甲板之上，还等他爬起来就听见周围有人喊：“航母左舷被鱼雷命中，机舱大量
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