迁都北京后，南京也留下了一套一模一样的朝廷机构，因而成祖在北京和南京都设置了左右两寺，分别设寺正一员，评事二员，以协助大理寺卿进行工作。从此之后，大理寺正式变成负责复核案件、平反冤狱的司法机关。
明代的“三法司会审”制度也进一步完善：唐朝的御史台变成了都察院，刑部、都察院主要负责初审案件，大理寺主要负责复审案件。十分重大复杂的案件，则在三法司的基础上会同六部尚书与通政使司共同会审，谓之“圆审”，也称“九卿会审”。
清朝在明朝的基础上进一步完善司法体系，创设了秋审、朝审等制度，让大理寺参与，不过大理寺的职权和明朝基本无二，只是品级降为正四品。到了清末光绪年，受维新运动影响，大理寺改为大理院，大理院正卿品级升到了有史以来的最高品。但清朝气数已尽，不待司法改革开始便灭亡了，大理寺也彻底退出了历史舞台。
因此从历史发展的角度来看，尤其是在人治为政治主体的封建社会，赵昺以为别说一步到位的推进到法治社会，就是后世法治依然有漫长的道路要走。基于这种判断，他以为在这种极为恶劣的环境之下，几个司法机构的生存都会受到威胁。
而法治是维持社会和谐及保证制度延续的重要措施，赵昺也只能走曲线救国的方法，将三个司法机构分别划入三个主体部门。这样即便以后发生变故，因为各方为了平衡权力，也会极力保护手中的这个重要部门，避免在朝争中被裁撤。
尽管这个方法很龌龊，但是赵昺也很无奈，社会的进步从来不是一蹴而就的，总需要一个发展和演变的过程，甚至会十分漫长和艰难。但终归要有人去做，赵昺此刻就是迈出的第一步，他不敢保证成功，只希望给后人留下一条路，甚至也许只是一个想法，那就足矣了……
赵昺花了一天的时间将自己的构思形成了文案，当然这也只是初稿，还很笼统，需要大量的细节去填充，或是做出修改。不过这也是他有意为之，他不能一下子将所有底牌亮出来，也要给其他人留有发挥的余地，以便在讨论中获得主动，哪怕是妥协。
至于关于内廷的设置和权力，赵昺有了思路，却并没有形成文字，也没有透露过多。但这个话题最后还是绕不过去的，他打算将此作为底牌，以此来控场。一旦局势失控，他就可以通过加强内廷的力量对外朝实施打压，收回部分权力；若是大家能够互相理解，并在些问题上做出妥协，那么他也不在乎放弃些原有的权力，归于外朝。
“两位
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