朱元璋知道他肯定自有见地，遂召入内室与之决策，刘基以为凡言降者或议逃者，都是为保住自己的地位，荣华，并出为他着想，应尽诛之，以免扰乱军心。
看朱元璋沉默不语，他又分析道：陈友谅骄气冲溢，目空一切，根本不把我们放在眼里，我们应利用其骄傲自满、听不进不同意见的时机，诱敌入伏，一举重创之，灭其锐气。
刘基说：“天道后举者胜，吾以逸待劳，何患不克，莫若倾府库，开至诚，以固士心，伏兵伺隙击之，取威制胜，以成王业，在此举也”。
正是在明国初创、百事待兴，又突临强敌、内部看法不一的危难紧急关头，刘基寥寥数语，拨开迷雾，点破形势，向朱元璋讲明了利害关系！
让他议定决策，团结人心，去为完成王业而进取。
至正二十七年(1367年)，参与制定朱元璋的灭元方略，并得以实现。共参与军机八年，筹划全局。
刘基不只是为朱元璋开创王业，安付出努力，在巩固明江山上，他也是拼尽了全力，(1367年)，朱元璋以刘基为太史令，刘基呈上《戊申大统历》。
荧惑星出现在心宿位，预示有兵灾祸乱，刘基请求朱元璋下诏罪己。
天气大旱，刘基请求处理久积冤案，朱元璋便当即命令刘基予以平反，大雨也就从天而降。刘基趁机请求建立法制，防止滥杀现象。
因为元朝顺帝作梦，得知真龙降生，一怒之下，三洗朱元璋的出生地，最后还是让朱元璋坐了天下，对于这件事情，朱元璋打从记忆时起，就记在心里。
一天，朱元璋正要处决囚犯，刘基便问是什么原因，朱元璋对他说道，昨天晚上，我作了一梦，醒来细想一下，觉得这梦不太好呀！
听到这些，刘基问所梦内容如何？朱元璋便将自己所做之梦一五一十的讲给他听，刘基细心的听完之后，面带微笑的连连摆着手说道：
“我皇，你错解了此梦呀！这是遇特别好的上上之梦，他暗示着你，是获得疆土和百姓的吉象，既然是好梦，万万不要乱杀！所以应当停刑等待。”
果然，三日之后，海宁归降，朱元璋很高兴，就将囚犯全部交给刘基释放了。
元至正二十七年(1368)即皇帝位，定都应天，国号大明。明王朝正式建立，授刘基为御史中丞兼太史令。
朱元璋即刘基皇帝位后，刘基上奏制定军卫法。当初确定处州税粮时，仿照宋制每亩加五合，唯独青田县除外，太祖
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