至战船大部分都是靠缴获来维持，都作院更多的事情是修修补补，而不是制造。而火枪、火炮这些武器的产量还很低，且形成战斗力还有很长的路要走。
另一方面宋军官兵的素质也很成问题，当然赵昺不敢奢望他们有知识、有觉悟，而是士兵的身体素质和训练都难以达到合格的标准。在帅府军初建的时候，他就发现分拨给自己的义勇和官军行军无力，而主要原因是他们处于半饥饿的状态，这除了行朝一直处于颠沛的状态外，还由于后勤、补给工作不良，难以筹措到足够的军粮，导致常常断粮。
在面临断粮之虞的时候，赵昺也发现其中半数以上的士兵体格羸弱，而且状似白痴、不堪教练。而赵孟锦和刘洙曾不止一次向自己提出，抽调可堪训练的士兵另组成军，保证饮食集中训练，其他的则归各队看管，当然也就谈不上训练，只承担军中杂役，在打仗的时候充当啦啦队以壮声势。
在崖山时，赵昺发现当初赵孟锦等人所提出的建议却是普遍存在的现象，即便是作为主力的淮军同样如此，而选出来所为强兵也只能勉强吃饱的状态，其他官兵只是饿不死而已。这也就是当他猎取鲸鱼后，并将肉分给各军后，立刻自己的处境便有所改观的原因。
而当行朝迁琼后，赵昺一直让殿前禁军进行整训，其实是在养兵，每日好吃好喝的补充营养、恢复体力，训练倒是处于次要地位。导致在前时的保卫战之时，他也是不敢将他们放在一线，而是作为预备队使用，防止他们被一击即溃，误了大事。
再有大家都知道近现代军队的标准一般是指具有以热兵器装备的部队、严格的军纪和完善的后勤保障系统。而当下赵昺虽然努力保证官兵吃好、喝好，并制定了伙食标准和一系列的相关制度，但是仍然由于后勤、补给工作的不良，遂增加了士兵不少杂务，侵占了训练的时间。
据赵昺观察和从统计报告中获知，一般部队因领取粮草、搬运、采樵和加工原粮等，每个月要占用十天左右的时间，一个指挥的兵丁往往会拨出三分之一的人力经常性的在从事杂役工作。这导致许多入营的新兵难以得到充分的训练，甚至连号令都分不清楚，这还只是在平日没有战事的情况下。
战时虽有组织起的民夫协助输送粮草，搬运军资，不过这是在本土作战的运输距离短，又有地方政府协助的情况下，勉强能保证供应。而一旦出岛作战便困难重重，此次征北军就遇到了，文天祥多次在奏报中称后勤不能适应军事要求，一般百姓多会远避。而旧政权已经溃散，新政权又难
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