采用的是甲厢式的结构，每一层甲板分左右安装了四十个火炮架设点位，四层甲板总共架设了三百二十门大中型火炮。而且火炮架设全在遮风避雨的甲厢内，根本无惧风雨。
船首船尾还有两个火炮陆基平台，每个火炮路基平台有二十个火炮架设点，能全方位无死角的炮轰靠近巨舰的战舰；还有五个不同方位，专供红夷大炮等重炮的火炮架设点。
整个巨舰装载的火炮数量已达到惊人的三百八十门，全是各式各样适用于海战的中型快炮，超大型的，经过改装的红夷大炮。
在船首、船尾还各有一个大型船舵。
因要操控如此庞大战舰的方向，寻常的木舵容易折断。方原根据沈茂提供的尺寸，专门在淘宝上找商家定制了特种钢和木质混合的船舵系统。从控制舵，到舵杆，再到舵叶，全都是由木质和特种钢材混合制成，一举解决了船舵坚固性的问题。
大型操作舵的直径至少半丈有余，需要三至五个舵手共同用力才能扳动使用。
甲板的前后，就是位于船首、船尾的两个船楼。
船尾的船楼有三层高，是专门用于指挥作战，召开军事会议，还有舰长等高层军官休息的地方。
船首的船楼只有两层，上层设置了瞭望塔，下方有两个大型水手舱。每个水手舱分为上下两层，每一层则有左中中右四排，有房间四十间。
按照方原人性化的设计，将每个房间层高加到接近一丈，长两丈，宽两丈。每个房间只安排8人住宿，解决水手住宿条件简陋的问题，这么大房间只住八人，至少比大学宿舍住宿面积更大。
连同船首、船尾的水手舱，共有房间一百八十间至两百间，总共可以承载水手一千五百人。
从水手舱再往下，就是通层的货舱，层高一丈。货物层隔开成前后两部分。前部是堆放淡水、食物的仓库，一次性能备足三个月连续航海所需的淡水，食物；后部则是存放火药、铅弹的仓库，若是堆放满仓，至少够打两次大型海战。
货物仓再往下就是密闭舱，密闭舱高三丈，占了船体高度的一半。
在海上需要风力驱动，在内河，或是无风的沿海，则需要人力来驱动。
巨舰的船桨舱有五十座巨型船桨，每个巨型船桨至少需要八人的人才能启动，方原在每个浆座安装了特种钢制的滑轮装置，每座只需要四人便能驱动。这么一来，四百水手就可以分成两班，轮流划桨，既节省了人力，又增加续航的时间。
巨舰的船
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