赵昺在万州盘恒三日，又召见了刚刚从陵水县返回的万州知军蒋科，其是宝佑年间进士，曾任琼山教谕，其文采卓著，弘扬文教，廉法事教，颇有建树被举荐为宜伦县令。在任上抚辑俚硐，教以诗书，深受俚人尊敬，帅府整饬吏治将其升任万安知军。
赵昺吩咐他蒋科用大军屯驻在此的机会，与俚人划定界线，约束其行为，减少与当地居民的纠纷，创造一个稳定的局面。其后他又叮嘱韩振要配合好地方工作，该出人出人，该出力出力。同时加紧练兵，做好战备，一旦有警，可以拉的动，用的上，顶得住。不仅能守住一方之地，还要做好随时增援琼州的准备。
赵昺的意思很清楚，他想将右军打造成一支水陆两栖部队，即精于陆战，又精于水战。这种考虑也是基于现实考虑，因为此时的水战可以说是陆战的延伸，并非现代意义上争夺制海权的海战，而是以消灭敌人有生力量，削弱其战斗力为目的的战斗。
所以海战伤亡巨大是难免的，且海上行舟不可意料的风险也比陆地上大的多，一场风暴便可将船只摧毁，溺死的人都是以千百论，更有甚者一支舰队都可能毁于一场飓风。而右军中的士兵多是由福建沿海地区的义勇组成，他们生活在海边，熟悉水性，适应船上的生活。让他们修习水战，一旦水军失利造成重大伤亡，可以让他们替代船上的战兵。
而让赵昺选定右军除了考虑到兵员组成外，还有便是主将韩振。其是殿前禁军出来的，而殿前禁军的主要任务便戍边和保护京师及皇帝的安全，受到的教育也是将忠于皇家放在第一位，耳染目睹之下多少怎么也会在其心中打下烙痕。再有韩振在禁军中地位不高，又有股二杆子劲儿，各方势力都不会将他作为拉拢的对象，也就是说政治上清白，不会轻易被朝中大佬们左右。
另一方面，跨海攻击敌占区，骚扰沿海，占领敌军海港，并摧毁他们的战船，借以打乱敌人的部署，将会成为帅府水军的一项常态话任务，而这些任务有的单凭水军是难以独立完成的，这便需要步军的配合。而这又要求配合作战的步军，不仅精通陆战，且要熟悉水战。其作战任务和训练方式与现代的海军陆战队类似，那经过两栖作战训练的右军便成为首选。
当然赵昺安排不仅限于右军。中军是帅府军的核心力量，征战中其担负着警卫帅府及保证殿下安全的重任，因而就要求它擅于防守，而不是长于进攻，所以赵昺把中军作为守卫琼州的主要力量；前军是一军的先锋，主要作战任务便是逢山开路遇水填桥，攻城掠地，扫清
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