专职刑狱案件的复审，司长从二品官，等同大理寺卿。
纪检司，行使之前都察院的职能，专职官吏、政务的勘察、弹劾，司长从二品官。
信访司，行使之前信访案件审核的职能，专职信访案件的审理，司长从二品官。
锦衣司，行使锦衣卫职能，司长为锦衣卫指挥使，二品官。”
方原的这次司法改革，就是将司法部门全部合并在一起，从六部里剥离，不再从属于内阁，而是直接归摄政王府直辖，摄政王府便完全掌控了大明的司法权。
方原又补充说道，“内阁、司法总督府，互不归属，直接上级都是摄政王府。但内阁首辅、阁员，司法总督府总督的任命，必须经由摄政王府提名，大明皇室，目前就是监国亲王的盖印才正式生效。”
众人听了方原制定的内阁、司法总督的任命流程，就是在切实的履行，他自己制定的虚君实相制，充分保证了大明皇室的权力。之前他们还以为方原是在唱高调，本质上还是想架空朱慈焕，独揽大权。但如今至少名义上，大明皇室虽然没有掌控内阁的行政权，但却拥有内阁、司法总督的人事任命权，严格意义上来讲，并不算是傀儡。
方原令总督府内务司的王承恩按照他的说法，书写了内阁、六部尚书、司法总督的任命书，再交由小苑盖上总督印后，直接交给了朱慈焕，令他盖印批准。
朱慈焕在众人前是赚尽了面子，逐一审阅任命文书后，掏出了暂制的监国玉玺，在任命书上盖印确认。
方原将盖了总督府印、监国玉玺印的任命文书交给了内阁首辅王秉鉴，“王阁老，内阁尽快下发公文，向南直隶、浙江、福建、广东各布政司、府、州、县宣布吧！”
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