行清理，利用历史上黄河数次改道的遗址，将进入平原以后的黄河分成三条主要的河道，在花园口西部开挖大型渠道，将黄河水进行分流，最主要的是将河水向后世缺水严重的河北地区引水。
黄河的含沙量在袁应泰在中上游进行大规模治理以后，开始减少，河水也变得清澈了很多，这两年流量也减少很多，这就充分满足了开挖引水渠道的先天条件，也就不会把大量的泥沙淤积的人工开挖的渠道里，形成二次淤积，避免渠水淤积别的河道。
到天启十一年也就是历史上的崇祯四年以后的两年，将是雨量非常大的年份，不但京师遇到大水灾，而且黄河还在孟津决口，导致黄河沿岸再次泛滥。因此，朱有孝就必须利用这两年的时间，极力进行水利建设，争取将这次的洪水充分储蓄起来，用以应付接下来的连年旱灾。
除了这两个地方以外，还有一个比较危险的地方，就是淮河流域，现在根本就没有后世那种强大的物资基础，也就无法建设大型水库，治理淮河的方法也只能向治理黄河那样，开挖渠道，拓宽京杭运河，尽量将淮河的洪水向北引流，再就是尽量储备粮食，应付即将来临的洪灾。
除了水利建设的速度需要加快，朱有孝还在极力修建道路。后世出现的“要想富，先修路”的观点，在现在更是重要，想要达到村村通水泥路面是不可能的，但是随着大明工业化的不断发展，原来的泥土路面肯定不在适应，无法满足日益发达的商品流通，为了进一步扩大商品的交流，必须修建更加结实的水泥路面，而且现在条件也允许了，大明户部有足够的资金支持修路。
朱有孝提出修建水泥路的问题，得到了内阁的支持，尤其是朱有孝讲到，随着道路的畅通，将来大明的商业会越来越发达，甚至仅是工商业的税金就可以完全满足大明的国家需求，甚至可以在一定的基础上免除农业税时，一向将钱袋子看的非常紧的户部尚书直接同意了支付修路的全面费用。
经过内阁和工部的商议，在今后的几年内需要修建两条南北方向的主干道，一天是沿着太行山东麓，从京师开始，直达汉口，最后通往广州，还有一条路就是从京师开始，沿着运河两岸南进，直接达到杭州。而从京师到沈阳的道路也是必须修建的，这条道路也是非常重要，对于整个北方的控制非常有帮助，同时也可以让南北的物资交流更加方便。
东西的干线就更加直接，就是后世的陇海线，不过现在的西段终点不再是兰州，而是直接准备修到边境的最西端，成为真正的一天大动脉，
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