桔梗山战役木叶大胜，不仅将砂忍彻底赶出火之国，还在山上捉了许多俘虏，包括小部分砂忍以及大量风之国平民。
而砂忍退出火之国，也代表着两国的战争将以木叶的胜利做为结局，而带来这一切的是大蛇丸！
于是顺理成章的，大蛇丸的名望瞬间达到顶峰，当他带着俘虏回村，木叶无数平民夹道欢呼，万人空巷。
猿飞日斩站在火影楼的天台上，眺望着这一幕，眼中却有几分凝重以及迟疑。
和砂隐村的战争暂告一段落，所以他派去协助大蛇丸的暗部也已经提前一步回来。
从暗部嘴中，猿飞日斩察觉到了一些身处地底的黑暗身影。
根部！
猿飞日斩的思绪逐渐飘到了过去。
四十多年前，木叶建立没多久，号称忍界之神的初代火影千手柱间去世了，他死后，木叶失去木遁，在忍界地位一落千丈，没多久就爆发一战，二代火影也挂了，之后猿飞日斩继承三代火影。
为了尽快提升村子的实力，猿飞日斩同意团藏的要求，允许他以‘暗部培训部’的名义成立根部，之后，为了预防九尾暴走的威胁，猿飞日斩又和团藏一起利用初代的细胞做人体实验，企图培育出新的木遁忍者！
没错，利用千手柱间细胞做人体实验的除了团藏，猿飞日斩也做过！
但遗憾的是，他们的人体实验全部失败，作为实验体的志愿者们也无一例外全部死亡。
猿飞日斩无奈，只得叫停实验，然后将实验的数据、记录等作为黑历史封存起来。
之后爆发第二次忍界大战，猿飞日斩的三个弟子，大蛇丸、自来也、纲手闯出了三忍的名号。
同时团藏的根部也活跃起来，到处搜集尸体和俘虏，猿飞日斩一看，暗想小老弟你是不是背着我偷偷的搞人体实验？
于是猿飞日斩将大蛇丸派过去给团藏当亲随，一是为了表示对团藏的信任与器重，二是监视团藏以及他的根部有没有在继续做人体实验！
通过大蛇丸，猿飞日斩确认了团藏没有继续研究，或许是抱着愧疚的心思，之后猿飞日斩对团藏更加信任，放权的尺度也越来越大，没过多久，猿飞日斩就随便找了个理由让大蛇丸离开了根部。
猿飞日斩以为事情就这样结束了，直到现在。
从暗部的汇报中，他发现跟随大蛇丸前往砂忍战场的除了暗部忍者，还有团藏的根部忍者。
而且到了战场后，大蛇丸竟然
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